硅藻土的重要用途之一是作助濾劑。利用硅藻土粉制品可以濾除液體中的固體顆粒、懸浮物質、膠體粒子及細菌，起到濾清和凈化液體的作用。
硅藻土助濾劑的主要用途有：
（1）調味品：味精、醬油、醋；
（2）酒及飲料：啤酒、白油、黃酒、果酒、葡萄酒，各種飲料；
（3）醫藥類：抗生素、合成血漿、維生素、中藥提煎液，各種藥水；
（4）水處理類：自來水、工業用水、工業廢水處理、游泳池水、浴池水；
（5）化學制品：無機酸、有機酸、醇酸樹脂、硫酸鈦液；
（6）工業用油類: 潤滑油、機械軋制冷卻用油、變壓器油，各種機油、柴油、汽油、煤油、石油化工；
（7）食用油類：菜油、豆油、花生油、茶子油、麻油、棕油、米糠油、生豬肉油；
（8）制糖業類：果葡糖漿、高果糖漿、甘蔗糖、葡萄糖漿、甜菜糖、甜葡糖、蜂蜜。
（9）其他類：酶制劑、植物油、海藻膠、電解液、奶制品、檸檬酸、明膠、骨膠等
硅藻土的第二大用途是作功能填料。主要應用于涂料、塑料、橡膠、醫藥、牙膏、磨料和化學試劑等方面，例如作結構填料可以調節涂層的光澤度和輝度。此外，硅藻土作磨料可以在銀拋光粉中使用，拋光金屬表面。它還可以作吸附劑，因為它可以吸附相當于自身質量2.5倍的水。經特殊加工的硅藻土粉甚至在加入本身質量50%的水后仍然似乎是“干”的。
硅藻土的主要通途主要有下列幾個方面。
利用硅藻土的絕熱、隔聲的性能可以用作水泥的輕質渾噩材料，制造輕質建筑磚、防火建筑材料和輕骨料。所制成的硅藻土裝飾板具有優良的適度調節作用，從而增加墻壁上的有益細菌，以分解污染物質而保持室內空氣清新。
利用其顯微孔隙及吸附性能在制糖、釀酒及其他食品工業和石油工業中用作液體過濾劑和漂白材料。
硅藻土在涂料、造紙、塑料、橡膠、殺蟲劑、化肥等工業中用作吸附劑、增強劑和填充劑。
在醫藥工業中用作抗生素、維生素及中草藥萃取物的過濾材料。
在環境保護上，硅藻土精土改性后可用作污水凈化材料。
硅藻土熔點高、熱穩定性好、耐酸，故制成隔熱磚和耐火石灰可廣泛用于各類窯業。
硅藻土在石油工業中還被用作添加劑和催化劑載體。
硅藻土被用作土壤調節劑以增強土壤保水、保肥、透氣能力。
利用硅藻土作添加劑生產的飼料有促進禽畜生長，提高肉質量的作用。
硅藻土與含碳物質、鹽水等混合可制成便于攜帶的固體燃料。
硅藻土還可用作防結塊劑、火柴頭和電焊條及水玻璃原料、炸藥穩定劑。
硅藻土還可用作陶瓷原料，如制造陶瓷墻面磚、化工用的多孔陶瓷；用硅藻土還可以制造用于生產光學玻璃的模具（瓷盒）。
硅藻土還被用作柔性磨料（拋光劑）。
硅藻土還用于生產釩催化劑載體。
劣質硅藻土可用來燒制陶粒，作瀝青路面填料和水泥混合材料。
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